Если во время загрузки fsck обнаружит повреждение файловой системы на диске, FreeBSD остановит штатную загрузку и перейдет в однопользовательский режим. Такое поведение системы в принципе разумно, но может стать проблемой, в случае если сервер управляется удаленно.
Сократить число переходов в однопользовательский режим, можно задав параметр в /etc/rc.conf:
fsck_y_enable="YES"
В этом случае fsck будет запущен с ключом -y и попытается исправить проблемы автоматически.
Но если на диске будет обнаружена серьезная ошибка, загрузка системы все равно будет прервана.
Более радикальный способ решения проблемы - отключение процедуры перехода в однопользовательский режим правкой rc.subr.